中正大學歷史研究所碩士班創立於民國八十年八月，大學部歷史系成立於八十二年八月，歷史所博士班成立於八十三年八月。

本系學士、碩士、博士班課程皆已完備，師資陣容整齊，14位專任教師、11位兼任教師，均具博士學位，學有專精，其研究領域涵蓋史學與思想、社會與宗教、政治與經濟等各領域，配合教師的研究專長，當可提供本系所完整的基礎、進階課程，兼顧廣度與深度，另如前文所言，本系除在學院內研究之外，更從事文史調查工作，促進學校與社區結合，開展另一項都市大學所無法獲得的特色。此外特別值得一提的是本系在中國中古史研教表現，如政治史、社會史、宗教史、歷史地理等範疇一應齊全，乃為本系創系以來維持之重要特色。

本系早期的發展重心，除了上述中國中古史外，近年來在台灣史方面亦有堅強的師資與研究陣容，使得本系所得以推動中國中古史、台灣史等兩大範疇的教學與研究，重訂必修學分數、重新調整研究生進修規則，充份配合發揮教師專長特色，並希望整合原有教師的研究領域成立各相關之研究群。此外，本系所近年來參與編修各地方志及整理中國佛教會檔案，徵集蒐求不少地方及宗教檔案，將來擬開設「台灣地方暨宗教檔案管理」相關課程，透過資料徵集、整理編目、分析研判，希望成為有效之數位典藏資料，茲以利師生及相關研究者。