（任職期間：2024.08迄今）

學位論文

1. 2021年  〈台湾をめぐる国家構想と政治意識（1943-1947）——国民政府と台湾人政治エリートの葛藤〉，東京：早稻田大學社會科學研究科博士論文。
2. 2007年　〈後冷戰時期日本東南亞政策的演進與調適——中國因素之影響〉，嘉義：國立中正大學政治學研究所碩士論文。

專書及專書論文

1. 待出版　〈出師未捷身先死——因理想而喪命的臺灣教育哲學家〉，收入葉亭葶、葉浩、吳冠緯主編，《林茂生文獻選輯》，臺北：臺大出版中心。（排印中）
2. 2024年2月  〈蒋介石：中華民国在臺湾の建国の父〉，收入根本敬・粕谷祐子編，《アジアの独裁と「建国の父」——英雄像の形成とゆらぎ》，東京：彩流社，頁277-306。
3. 2024年1月  〈廖文毅《台灣民本主義》一書之誕生（1948-1957）〉收入何鳳嬌、林本原、薛月順編，《解讀檔案．書寫歷史——國史館2022年學術討論會論文集》，臺北：國史館，頁71-97）。（另收錄於2023年2月〈廖文毅《台灣民本主義》一書之誕生（1948-1957）〉，廖文毅著，龔昭勲、葉亭葶譯，陳儀深、葉亭葶主編，《台灣民本主義》，臺北：政大出版社、國史館，頁5-36。）
4. 2022年11月  〈從大中華民國主義者到混血臺灣民族論者——廖文毅政治思想再探〉，收入薛化元主編，《2021年二二八、人權、民主與轉型正義學術研討會論文集》，臺北：財團法人二二八事件紀念基金會，頁37-69。
5. 2020年4月  〈臺灣復歸中國後之政制、行憲構想：以在渝臺籍精英為中心〉，收入李福鐘等主編，《跨域青年學者臺灣與東亞近現代史研究論集——第四輯》，臺北：國立政治大學臺灣史研究所，頁361-391。
6. 2017年2月  〈1945「謀議臺獨案」再探：兼論政權換初期臺灣人的選擇、對應與困境〉，收入許文堂編，《軍事占領下的臺灣》，臺北：臺灣教授協會，頁103-172。
7. 2016年10月  〈從柳文卿事件探討日本政府對臺獨運動者居留政策之轉變過程：兼論對在日臺獨運動的影響〉，收入臺灣歷史學會編，《殖民．再殖民．獨立自主：臺灣歷史學會創立20週年研討會論文集》，臺北：吳三連臺灣史料基金會，頁239-276。

期刊論文

1. 2020年7月  〈台湾人政治エリートの民主への追及と挫折―台湾省行政長官公署の「民主」認識との比較を兼ねて〉，《現代台湾研究》，第50期，頁1-28。
2. 2019年5月  〈戦後初期台湾に於ける漢奸懲罰政策と台湾社会の反応―公民権停止を中心に〉，《北東アジア地域研究》，第25期，頁118-131。

會議論文

1. 2022年12月  〈廖文毅《台灣民本主義》一書之誕生（1948-1957）〉，發表於國史館主辦，「解讀檔案，書寫歷史—國史館2022年學術討論會」。
2. 2021年10月  〈廖文毅的政治思想：以混血臺灣民族論及理想政體為中心〉，發表於財團法人二二八事件紀念基金會、二二八國家紀念館主辦，「『二二八、人權、民主與轉型正義』學術研討會」。
3. 2021年10月  〈國府與臺灣政治精英在臺灣治理構想上的衝突——從行政長官公署正式統治臺灣前談起〉，發表於中央研究院近代史研究所胡適研究群、蔣介石研究群合辦，「現代中國的戰爭政治與外交（二十）工作坊」。
4. 2020年10月  〈從戰臺灣地方自治的施行看國家統一與政治民主的矛盾〉，發表於國立政治大學人文中心、國立政治大學歷史學系、中國社會科學院近代史研究所民國史研究室、中國社科學院世界史研究所、「近代中國與東亞」研究群、中央研究院近史研究所蔣介石研究群、東京大學總合文化研究科合辦，「第5屆『百變民國：戰後中國與東亞變局』青年學者論壇」。
5. 2019年12月  〈台湾人政治エリートの民主への追及と挫折——台湾省行政長官の『民主』認識との比較を兼ねて〉，發表於日本臺灣學會與臺灣史研究會合辦，「第17回日本臺灣學會關西部會研究大會」。
6. 2019年3月  〈二戰後臺灣復歸中國之政制構想——以在渝之臺籍菁英為中心〉，發表於國立政治大學臺灣史研究所、中央研究院臺灣史研究所、東京大學大學總合文化研究科、一橋大學大學院社會學研究科、早稻田大學臺灣研究所、立命館大學文學部合辦，「第四屆臺灣與東亞近代史青年學者學術研討會」。
7. 2019年3月  〈戦後初期台湾における漢奸政策——停止公権を中心に〉，發表於高麗大學GLOBAL日本研究院、早稻田大學先端社會科學研究所合辦，「国際ワークショップAsia Circuit Workshop no.2『認識と政治』」。
8. 2018年12月  〈半山推動臺灣光復過程之探討——從中日開戰到開羅宣言〉，發表於中央研究院近代史研究所胡適研究群、蔣介石研究群合辦，「現代中國的戰爭政治與外交（十一）工作坊」。
9. 2018年11月  〈戰後初期在臺漢奸審判——兼論在臺「抗日史觀」的分歧〉，發表於中央研究院近代史研究所主辦，「東亞冷戰史的重構國際學術研討會」。
10. 2018年9月  〈台湾における漢奸裁判と台湾社会の反応——皇民奉公会を中心に」〉，發表於北東アジア學会主辦，「第24回北東アジア學会學術研究大会『北東アジア地域協力の新段階構築に向けて』」。
11. 2018年7月  〈臺灣精英的國家構想與政治意識——從開羅宣言到二二八事件〉，發表於中研院近代史研究所、南開大學歷史學院、華中師範大學中國近代史研究所合辦，「通商口岸與近代世界的形成」會議。
12. 2016年12月  〈戰後臺灣人的中國意象〉，發表於日本早稻田大學東アジア国際関係研究所主辦，「和解への道―次世代研究者シンポジウム」。
13. 2015年10月  〈柳文卿事件始末及日本對臺灣獨立運動政策之轉向」〉，發表於臺灣歷史學會、臺灣教授協會、吳三連臺灣史料基金會合辦，「殖民．再殖民．獨立自主研討會」。
14. 2015年10月  〈帝國夾縫中求生的臺灣—— 一九四五年『八一五獨立事件』再探」〉，發表於臺灣教授協會主辦，「軍事佔領下的臺灣(1945-1952)——張炎憲教授逝世週年紀念學術研討會」。

研究計畫

1. 2020年4月-2024年3月  「権威主義体制の正統性としての「建国の父」——その継承と変容の比較研究」，科研基盤（B）（日本政府文部省申請之科学研究費助成事業），計劃編號：20H01454。（研究代表：根本敬／上智大学アジア文化研究所，本人為協同研究者）

口述歷史

1. 2023年10月  〈王昇將軍的貼身機要：王耀華先生訪問紀錄〉，訪問：蘇聖雄，陪訪：葉亭葶，紀錄：林東璟，收錄於中央研究院近代史研究所編輯委員會編 ，《口述歷史(17)：戰後臺灣政治史專號》，臺北：中央研究院近代史研究所，頁81-174。
2. 2023年10月  〈鮮為人知的沈之岳辦公室：楊明恆先生訪問紀錄〉，訪問：蘇聖雄，陪訪：葉亭葶，紀錄：林東璟，收錄於中央研究院近代史研究所編輯委員會編 ，《口述歷史(17)：戰後臺灣政治史專號》，臺北：中央研究院近代史研究所，頁175-213。
3. 2022年11月  〈林雪梅、王明理（近藤明理）女士 訪問紀錄〉，訪談人：薛化元，紀錄/整理：游淑如、葉亭葶、周俊宇，收於薛化元、許文堂編著，《戰後「黑名單」問題之調查研究計畫》，臺北：允晨文化，頁315-333。
4. 2021年11月  〈張富忠先生訪談錄〉，訪談人：陳世宏、葉亭葶、羅國儲，紀錄/整理：羅國儲、葉惠芬，收錄於陳儀深主編，《中壢事件相關人物訪談錄》，臺北：國史館，頁117-158。

學術翻譯、審訂

1. 林茂生著，葉亭葶譯，〈王陽明的良知說〉，收於葉浩、葉亭葶主編，《林茂生文獻選輯》，臺北：國立臺灣大學出版中心。(預訂2024年6月出版)
2. 宗像隆幸著，龔昭勲譯，蔡錦堂、王麒銘、葉亭葶審訂，《宗像隆幸與彭明敏往來書信集》，臺北：國史館，2024年。
3. 廖文毅著，龔昭勲、葉亭葶譯，陳儀深、葉亭葶主編，《臺灣民本主義》，臺北：政大出版社、國史館，2023年。
4. 岡野翔太著，葉亭葶譯，〈從「華僑」到「臺灣人」——一九六零年~七零年代在日臺灣人之歷史自我省察〉，收於林初梅、所澤潤、石井清輝編著，《日本時代的殘光餘影》，臺北：允晨文化，2023年，頁253-292。