學術交流與合作：
本系為加強雙方學術交流與合作，先後與數個學術單位簽定合作協議，協議要點如下：
- 雙方學術交流與合作方式包括：
- 在教學方面：雙方定期交換有關研究生的教學計畫和教材；創造條件設立合作課程，共同培養研究生，並派遣學生進修對方的學位課程。
- 在研究方面：就共同感興趣的問題進行實地考察與合作研究，聯合主辦有關方面的學術會議，出版學術論文集及其他協作研究成果。
- 教職員交流：根據可行性和需要，邀請對方的學者來訪，並進行教學、專項研究和交流課程設計的心得與材料。
- 致力發展其他雙方具共同興趣領域的合作與交流。
目前與本系簽有協議單位計有：
中國大陸中山大學歷史學系、中山大學社會學與人類學學院、北京首都師範大學歷史系、北京師範大學歷史學院、四川大學歷史系所、北京大學歷史系、北京大學中國中古史研究中心、陜西師範大學唐史研究室等。
校際選課：
本系為充分利用雙方師資、設備、圖書，以提高教學水準，特與數個學校相關系所定有合作交換選課協議書，協議要點如下：
- 合作範圍以課程（包含實習課程）之互選，圖書期刊之通用、儀器設備之互用、專題研究之合作為限。必要時得經雙方同意，擴大或縮小合作範圍。
- 參加互選某課程之學生人數，以不超過該課程之學生容量為原則。
- 雙方學生互選科目之學分數，須符合所屬學校之相關規定。
- 參加互選之學生應依對方學校規定之時間、程序辦理選課及繳費。
- 目前與本系定有合作交換選課協議之學校：台大歷史學系、台大人類學系、中興大學、中山大學、嘉義大學、成功大學等。
** 校際選課注意事項：
- 校際選課以本校各系所未開設之科目為原則。
- 大學部學生每學期校際選課之科目學分數最高以六學分為限，且不得超過該學期在本校選課總學分數之三分之一。研究生校際選課學分數由相關系所主管核定。校際選課學分數併入當學期修習學分數上下限計算。
- 修習他校課程務必瞭解並遵守開課學校之有關修課規定。
- 學生申請校際選課須於加退選截止前辦理完畢逕送教學組，逾期不再受理。